何にもしていません

On 2014/11/2 日曜日, in hypoxia reseacrh, by bodyhacker

日当直です。

金曜日はちょっとエライ目に遭ったのですが、今日は今まで平穏で意味のあることは一切していません。



Nature誌に”The Top 100 Papers“という記事が掲載されていてちょっとした話題になっています。

科学論文の引用索引であるSCI(Science Citation Index)の初版が発行されてから50年になる。SCIは、Eugene Garfieldが設立した科学情報研究所(ISI)によって1964年5月に印刷版の提供が開始され、研究者たちのデータ検索に非常に大きな変化をもたらした。その後の電子版提供の影響は特に著しく、研究論文の重要度評価のためのモデルの1つとなった。この50周年を記念して、Nature はSCIを現在所有するトムソン・ロイター社に、オンライン学術データベース「Web of Science」にある被引用数が多い論文のオールタイムベスト100のリストアップを依頼した。これはなかなか面白い試みであることが明らかになり、また非常に意外な結果も示された。

という内容となっています。

「また非常に意外な結果も示された」という処が今回の記事の肝となっているのです。

例えば”The discovery of high-temperature superconductors, the determination of DNA’s double-helix structure, the first observations that the expansion of the Universe is accelerating”などのノーベル賞を受賞した仕事についての論文はTop100のリストには入っていません。 その代わりに実験手法やデータの解析方法の論文が軒並み上位を占めるという結果なったのです。 例えば10位までをリストアップしてみると以下の様な結果となっています。

Rank: 1 Citations: 305,148 Protein measurement with the folin phenol reagent. Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L. & Randall, R. J. J. Biol. Chem. 193, 265–275 (1951).

Rank: 2 Citations: 213,005 Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Laemmli, U. K. Nature 227, 680–685 (1970).

Rank: 3 Citations: 155,530 A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Bradford, M. M. Anal. Biochem. 72, 248–254 (1976).

Rank: 4 Citations: 65,335 DNA sequencing with chain-terminating inhibitors. Sanger, F., Nicklen, S. & Couslon, A. R. Proc. Natl Acad. Sci. USA 74, 5463–5467 (1977).

Rank: 5 Citations: 60,397 Single-step method of RNA isolation by acid guanidinium thiocyanate-phenol-chloroform extraction. Chomczynski, P. & Sacchi, N. Anal. Biochem. 162, 156–159 (1987).

Rank: 6 Citations: 53,349 Electrophoretic transfer of proteins from polyacrylamide gels to nitrocellulose sheets: procedure and some applications. Towbin, H., Staehelin, T. & Gordon, J.

Rank: 7 Citations: 46,702 Development of the Colle-Salvetti correlation-energy formula into a functional of the electron density. Lee, C., Yang, W. & Parr, R. G. Phys. Rev. B 37, 785–789 (1988).

Rank: 8 Citations: 46,145 Density-functional thermochemistry. III. The role of exact exchange. Becke, A. D. J. Chem. Phys. 98, 5648–5652 (1993).

Rank: 9 Citations: 45,131 A simple method for the isolation and purification of total lipides from animal tissues. Folch, J., Lees, M. & Stanley, G. H. S. J. Biol. Chem. 226, 497–509 (1957).

Rank: 10 Citations: 40,289 Clustal W: improving the sensitivity of progressive multiple sequence alignment through sequence weighting, position-specific gap penalties and weight matrix choice. Thompson, J. D., Higgins, D. G. & Gibson, T. J Nucleic Acids Res. 22, 4673–4680 (1994).

一位は誰でも知っている蛋白定量法の一つであるLowry法の報告です。 ちなみにMullisによるPCR法の報告は63位です。

Rank: 63 Citations: 15,160 Primer-directed enzymatic amplification of DNA with a thermostable DNA polymerase. Saiki, R. K. et al. Science 239, 487–491 (1988).

100位で被引用回数は12,119となるようですし10,000回以上は148篇、1,000回以上の被引用回数の論文は14,499篇に留まるようです。 Google Scholarの統計を用いた結果も参照できて似たような傾向です。 Google Scholarだと

Citations: 223,131 Cleavage of structural proteins during the assembly of the head of bacteriophage T4. Laemmli, U. K. Nature 227, 680–685 (1970).

Citations: 192,710 Protein measurement with the folin phenol reagent. Lowry, O. H., Rosebrough, N. J., Farr, A. L. & Randall, R. J. J. Biol. Chem. 193, 265–275 (1951).

Citations: 190,309 A rapid and sensitive method for the quantitation of microgram quantities of protein utilizing the principle of protein-dye binding. Bradford, M. M. Anal. Biochem. 72, 248–254 (1976).

一位から三位はこのような結果となっています。

ちなみにTakahashi & YamanakaのiPS細胞の報告 Induction of Pluripotent Stem Cells from Mouse Embryonic and Adult Fibroblast Cultures by Defined Factors Volume 126, Issue 4, 25 August 2006, Pages 663–676 は10821回(Google Scholar)

今年のノーベル賞論文である The hippocampus as a spatial map. Preliminary evidence from unit activity in the freely-moving rat Brain Research Volume 34, Issue 1, 12 November 1971, Pages 171–175 は2662回(Google Scholar)の被引用回数です。

ノーベル賞を受賞すると被引用されやすくなるでしょうから単純には比較できませんが…

これをどのように解釈するかについてはいろんな意見があると思います。 少なくとも一線を画したと後に考えられる論文は10年もすれば1000回は引用されるだろうからそうでない論文はそう考えられていないとかもというくらいはいえるのかも知れません。

こんなtweetもありました。



すごいです。 学者冥利に尽きますね。

ぼくも1000回はなんとか目指したいのですが…


スポーツ遺伝子は勝者を決めるか?: アスリートの科学」 を読みました。

「世界記録はどこまで伸びるのか」 とか 「「黒人はなぜ足が速いのか―「走る遺伝子」の謎」

といったような人間の運動能力を論じたものです。 どこまでが遺伝子で決まっていてどこからがトレーニングなどで獲得したものかということが議論になるし最近ではエピジェネティックスな影響があるのかないのかなども焦点になると思います。

第13章はいわゆる「高地順応」についての章「世界で最も思いがけない(高地にある)才能のふるまい」です。 最近Genes & Developmentによい総説が出ていました。figure4面白いですけど怪しい感じもしますというか怪しいだろう。

Human high-altitude adaptation: forward genetics meets the HIF pathway Abigail W. Bigham and Frank S. Lee Genes Dev. 2014 28: 2189-2204


「数独」を数学する-世界中を魅了するパズルの奥深い世界

これめちゃくちゃ面白いです。

「数独」を数学する-世界中を魅了するパズルの奥深い世界-

さて明日の朝までこれからどうしよう。


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