恒例ですので今年も「ハイポキシア生物学の2015年を振り返って」をやります。


~メトリクス~

pubmedで”HIF[TIAB] and 2015[DP]” (2015 12/28)と検索窓にと検索窓に入力すると1712篇の論文があると返ってきます。HIF[TIAB] and 2014[DP]では1705篇です。

“hypoxia[TIAB] and 2014[DP]” では6081篇だったのが”hypoxia[TIAB] and 2015[DP] “(2015 12/28)では6207篇です。毎年これだけの論文が安定的に出ているという事に驚きます。

ちなみにコントロールの”iPS[TIAB] and 2014[DP]”では728篇で”iPS[TIAB] and 2015[DP]” (2015 12/28)では724篇でした。

 


~注目論文~

論文のチェックを毎週行っています。 まずタイトルを読んでこれはと思うとアブストラクトまで読みます。そこから図までチェックする論文は毎週20篇くらいはあると思います。 そこから論文を印刷して赤ペンでチェックしながら全部読んで引用文献もチェックした論文にはPapersで★を五つの満点をつけます。

数が多くなってはシグナルとしての効果が薄くなるのであまりたくさんの論文には★★★★★をつけません。

以下★★★★★の論文の一部を列挙してみます。

 

#1 Hypoxia Signaling Cascade for Erythropoietin Production in Hepatocytes. MCB 鈴木さんの研究室からの論文。

#2 Glutathione and thioredoxin antioxidant pathways synergize to drive cancer initiation and progression. Cancer Cell 一種のリバイバルですね

#3 Insulator dysfunction and oncogene activation in IDH mutant gliomas Nature


ミトコンドリア関連

#4 Supporting Aspartate Biosynthesis Is an Essential Function of Respiration in Proliferating Cells Cell

#5 An Essential Role of the Mitochondrial Electron Transport Chain in Cell Proliferation Is to Enable Aspartate Synthesis. Cell

#6 Metabolic rescue in pluripotent cells from patients with mtDNA disease. Nature

#7 Mitochondrial reticulum for cellular energy distribution in muscle. Nature

#3 “にはちょっと驚きました。

“#4″ ,”#5″ は最近のぼくの研究の興味もあって興味をもって精読しました。

 

#8 A lactate-induced response to hypoxia. Cell 

#9 Ferritin-Mediated Iron Sequestration Stabilizes Hypoxia-Inducible Factor-1α upon LPS Activation in the Presence of Ample Oxygen. Cell Reports 

ちょっとホントかねとも思いましたがおもしろいことにはおもしろい。

 

最後に

#10 Hypoxia fate mapping identifies cycling cardiomyocytes in the adult heart. Nature

#11 Integrated molecular analysis of adult T cell leukemia/lymphoma. Nature Genetics

以下の二つとくに#11 “には脱帽です。


今年一年ぼくたちのjournal clubで読んだ論文をまとめて見ました。

http://togetter.com/li/912111

 

もう死んでしまった師匠は研究はウシの涎の様なものだ、つまりキリがないのだと常々話していました。

ぼくは低酸素研究の以前にはthioredoxinという小さいー分子量が小さいという意味ですー蛋白質の研究をしていました。今まで細々としか続けてこなかったthioredoxin研究をぼくのメインテーマに据えて行こうと思っています。

 

2016年もしばらくはこのブログは続けるつもりです。

 

最後に

<blockquote class=”twitter-tweet” lang=”ja”><p lang=”ja” dir=”ltr”>なんだかんだいって、学位論文を出すことが大学院生に課せられているものです。これは何を意味するかというと、「オリジナル」を生み出せ、ということです。自分の専門分野については、指導教授よりも詳しくなれということ。大学院の様相はもの凄い勢いで変転していますが、この根幹は変わりません。</p>&mdash; 丸島和洋 (@kazumaru_cf) <a href=”https://twitter.com/kazumaru_cf/status/682257610892955649″>2015, 12 30</a></blockquote>

<script async src=”//platform.twitter.com/widgets.js” charset=”utf-8″></script>

だってさ。

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