Dr. Bonoの生命科学データ解析-読書会 @大阪 参加者募集中です。

昨日丸一日、日当直でした。

夕ご飯食べてシャワー浴びてから働きました。


論文がアクセプト

大学院生の先生の論文がアクセプトされました。

「箸の上げ下ろし」まで指導してくれるある意味妙に親切ーそれでいで一切の追加実験を要求しないーなreviewersだったので書き換え作業をしただけなのですがそれでも二回もrevisionをさせられました。

最初に投稿した雑誌のreviewerにはこれが本当ならこの業界の常識が変わるのだからお前らの主張を簡単には受け入れられないとまでいわれた-Thus, proposing such a paradigm change or new mechanism must be accompanied by evidence demonstrating that …-のでとにかく皆が知っている雑誌に通してしまいたいという気持ちが強くて最終的にはPLOS ONEに採ってもらいました。

皆に受け入れてもらえる様にdataの出し方も工夫したしまあよかったと思います。

figureが8つでsupplementaryが9つで学位審査で全部説明していたら二時間くらいかかるかもしれません。

よかったです。


「教科書が読めない」

AI vs. 教科書が読めない子どもたち

AI, AI技術の解説書なのですが格好の例(東ロボくん)を用いているのでとても分かりやすいというか分かった気にさせられました。

医療の世界では、AIとかAI技術の導入より前に日本ではもっと規制緩和をすすめる必要はあると思います。「電子カルテ」もひどい。診療録や画像の共有だってまだまだだし。遠隔診療もいいけどここら辺をまず進めたらいいと思います。

 

第3章と第4章がこの本のキモだと思うのですがぼくの個人に戻って考えてみるとすでに手遅れですね。

 

入学試験のミスが発覚してちょっとした議論を呼んでいます。

新聞ではこんな論説も見つかります(参照1), (参照2)

そうであれば、試験実施後、できるだけ早く問題と模範となる解答例を公表すべきだろう。

というのですが、国語とか英語の論述問題では逆に大きな混乱を呼ぶような気もします。そもそもこのような問題がどのように採点されてるのかの実態を無視している議論と思います。


生駒さんが「卒業」

乃木坂46の生駒里奈さんが「卒業」だそうです。 彼女自身以下の様に語っています。(参照)

20歳になった頃から、大人として一人で生きていくためにはどうしたらいいのか、具体的に自分のこれからを考えた時に私はこのままでは足りないなと、プラスで自分を高めないといけない。 ここだけじゃ足りないと思う様になりました。

ぼくも

50歳になった頃から、ピークをすぎた老研究者として生きていくためにはどうしらいいのか、 具体的に自分のこれからを考えた時に私はこのままではやりすぎなので、 もう自分を高めようというような無駄な努力やめようと思う様になりました。

結構やったしもう多分ホームランとか三塁打-被引用回数が500回を超えるは打てないだろうという気もしているわけです。研究を止めた知り合いも何人もいるし。

とはいえ研究をしている犬も歩けば棒に当たるという具合で何かを見つけたりするのでなかなか「卒業」できません。

恩師には、研究は牛の涎みたいにキリががないからほどほどにしろといわれました。 でも、その「ほどほどが」わからないのです。 その恩師とて、定年で退職する少し前からしきりに自分が行けー院長としてですけどーと言われている病院は普通の病院だからもう研究ができなくなるのだもっと時間があればいろんなことができるはずなのに悔しいとぼくに語っていました。

時々先生の魂がまだ漂っているような気もするし。


PubMedCommonsが閉鎖

だそうです。

やっぱり匿名でないと「談論風発」しないのでしょうか。


研究室でどう集中力を持続するか

研究室ではこんなメガネを使っています。(JINS MEME)

朝出勤するとこれに着替えます。

なんか強制的に集中モードに誘われる感じがしてこのメガネをしている間は一種の戦闘モードになります。

今日は今まで

深い集中:1:45

集中:3:15

です。


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PNASから
Oxidation-induced intramolecular disulfide bond inactivates mitogen-activated protein kinase kinase 6 by inhibiting ATP binding

PNAS published ahead of print November 15, 2010, doi:10.1073/pnas.1007225107

これはおもしろいです。昔のぼくが書いていたとしても不思議でないテーマです。

IMG_1144

最新号のブルータスの特集は「映画監督論」です。

映画監督の年収ってどれくらいなのでしょうか。

例によってピンからキリなのですが、

2009年の高い方は

1 マイケル・ベイ 1億2000万ドル

2 スティーブン・スピルバーグ 8500万ドル

3 ローランド・エメリッヒ 7000万ドル

4 ジェームズ・キャメロン 5000万ドル

となっているそうです。

すごいですね。映画監督って一発当たるとすごいことになるんですね。俳優より儲かるのかもしれません。

映画監督はいくら太っていてもまた不細工でも全然平気ですからそこら辺を考えればあたればなかなかいい商売なのかもしれません。

ウッディアレンもこの特集のインタビューで映画監督は快適な職業だと語っています。

何も不満はない。まじめな仕事で、十分な収入がある。エレベーターを動かしたりタクシー運転手をするよりずっといい仕事で、きれいな女優や面白くて才能ある男優達、と働くことができる。

ウッディアレンと比べてもしようがないわけですが日本の映画監督はなかなかそううまく儲からないようです。
是枝裕和さんは「職業としての映画監督は割に合わないかも」と言っています。

研究者も大概快適な職業だと思います。

世の中では論文が無いと研究費が無くて大変とか言われることもありますがそんなことはありません。

NatureだScienceだCellだ Genes & Devだとかいっているのは実はほんの一握りの人たちです。そんな雑誌に論文がなくとももっと言えば何も論文などなくともたいていは何の問題もありません。

以前在職したぼく研究所での給料は現在の当直代、超勤代が入った給与よりも多かったし、文部科学省の科研費など当たらなくともーそもそもそんなものに応募しない人も大勢いましたー研究費は降りてきていました。研究費の心配をしている人など廻りで見たことも聞いたこともありませんでした。

論文が出ないなどの理由で解雇された人はぼくの在職中見たことはありません。

職にありつくのは最近では結構大変なようですがありついてしまえばこんな暢気な商売はないかもしれません。

それでは医者はというとこれはピンからキリですね。大もうけをしてる開業医さんはいるかもしれませんがその他は働いている時間相応といったところでしょうか。

自治体病院とか独法系の職場ー大学病院も含みますーは働いても働かなくても給与にそう大きな差はありません。週に一回しか手術室に出ない人も週に4日出る人も基本的には給与に差は無いわけです。うまく立ち回り”働かない組み”に入れば大学の教員もかなりいい商売です。

文学部の先生とぼくらはまったく同じ俸給表なのですから驚きます。

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最後にお口直しにポジティブになれる報告を紹介します。

Scienceのこの論文は面白いです。
A Wandering Mind Is an Unhappy Mind

Science2010: Vol. 330. no. 6006, p. 932 DOI: 10.1126/science.1192439

iPhoneのアプリを使った研究結果の報告です。その名も trackyourhapinessです。 urlはwww. trackyourhappiness.org。

2200人の被検者から25万件のresponseを集めて解析した研究です。

どのような活動をしているときに人は一番幸せを感じるかという調査。
方法は以下の通り

To find out how often people’s minds wander, what topics they wander to, and how those wanderings affect their happiness, we analyzed samples from 2250 adults (58.8% male, 73.9% residing in the United States, mean age of 34 years) who were randomly assigned to answer a happiness question (“How are you feeling right now?”) answered on a continuous sliding scale from very bad (0) to very good (100), an activity question (“What are you doing right now?”) answered by endorsing one or more of 22 activities adapted from the day reconstruction method (10, 11), and a mind-wandering question (“Are you thinking about something other than what you’re currently doing?”) answered with one of four options: no; yes, something pleasant; yes, something neutral; or yes, something unpleasant. Our analyses revealed three facts.

一番はセックスをしているときで平均幸せ度は100満点のうち90くらいという高さです。次は exercisingで75くらい。テレビを見ているときは65、食べているときは68で子供の世話をしているときでも66くらいです。
すごいですねセックス。なんかこんなにダントツだとそんなものかなと言う気もしてきました。

この研究はなにもセックスの奨励ではないのでセックス中は人は行為に集中しているということが肝のようです。

何をしているときでもとにかく集中しているときはハッピー度が高くなるようです。

そういえば麻酔しているときも集中しているとあっという間に時間が過ぎて終わった後すごく爽快になりますよね。
若い先生方も外来でうだうだ患者を診ているより手術室で勝負するような診療科に進んだ方がハッピー度が上がると思います。


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集中力の射程

On 2010/10/7 木曜日, in Thus Spoke Dr. Hypoxia, by bodyhacker

結局昨晩は睡眠6時間程度でしたが今日はとても体調がよく完徹のaftermassはありませんでした。”修行”により体質が改善したのでしょうか。最近は酒にも結構強くなったしもしかしたら解脱したのかもしれませんね。それとも二日三日してから効いてくるボディーブローのようなものとなるのでしょうか。

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ノーベル文学賞の発表がいよいよ明日となりました。村上春樹氏が受賞した場合どこかのテレビにでるのでしょうか。夜9時には寝ているはずなので夜のニュース番組への出演はできないのでしょうか。そこら辺が気になります。

さて彼のインタビュー集が出版されました (夢を見るために毎朝僕は目覚めるのです
)。

ざっと二回ほど読みましたが受賞しても”俺は何もしゃべるつもりはないのでこの本読んでくれ”というメッセージなのではないかと思うくらい結構いろんなことを語っていると思います。これで映画のノルウェイの森も大当たりで勘違いして映画を観に行ったおじさん、おばさん、おじいさん、おばあさんの顰蹙を買ってしまうなど想像するだけで楽しくなります。

18本のインタビューが収められていますが一番面白かったのはロシアの読者との一問一答形式の2003年のもの「お金で買うことのできるもっともすばらしいもの」でした。自分の小説の最終目標を「カラマーゾフの兄弟」に置いていると断言していました。

2004年に行われた「何かを人に呑み込ませようとするとき、あなたはとびっきり親切にならなくてはならい」も興味深いものでした。心情的には村上氏も「世界の終わりとハードボイルド・ワンダーランド」が一番好きかもと言っています。神戸の人間より、京都に人間の方がよほどエキセントリックだとも言っていますが、これの真偽はぼくには判断できません。神戸の人間をそんなに知らないし京都の人間と言ってもぼくが付き合っているのは大学周辺のはじめからエキセントリックな人が集まっていそうな場所に生息する人たちだから。

小説創作における集中力の話をしている箇所がありました。

音楽と小説創作では集中力の外見が違っているだけで集中力が中心的な役割を担っているということは同じだと。
ぼくは医者で研究者ですが、医療も研究も一番大切なのは集中力です。
医者と言ってもぼくは麻酔科の医者ですが、この場合、集中力は短期間ー 24時間を超える手術に最初から最期まで付き合うことはまれですーでありより tangibleなものです。患者が覚醒して家に帰るまでは毎日患者に集中しています。もちろん強弱をつけなければ毎日朝から晩までやっていることはできません。たまに、お前は時々眠っているだろうというツッコミもあると思いますが眠っていても集中はしています。ここら辺は麻酔科の医者にはよく解っていることですが他の人には理解が難しいかもしれません。研修医などは覚醒しても全然集中していませんしね。麻酔が要求する集中力はプロセスがおわればそこからは解放されます。その意味では短期決戦です。

一方、研究は集中力の射程はもっと長いしまた内省的です。麻酔よりは強い耐性も必要だと思います。

この辺が判らないとなかなか自分がやっていることの意味あいが感覚的につかめずに悩んでしまうこともあるような気が
します。
うちの先生方はどういう風に感じているでしょうか。

夢を見るために毎朝僕は目覚めるのです

御大ブログにこんなエントリーがありました。
書けません普通の人には。

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