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ずいぶんと間が空きました。

何か春だなと思っていたら昨日から寒くなりました。

1月は中旬までは余裕だったのですがは首が廻らないくらいにやるべき事がたまってきています。

論文のrevisionが二つと新しい論文となんかなんかで…

Solid State Survivor YMO 

今週、YMOを集中的に聴いていました。

時間があったので家で正月に放送されていた 名盤ドキュメント「ＹＭＯ“ソリッド・ステイト・サヴァイヴァー”」と細野晴臣「イエローマジックショー2」の録画も観ました。

 名盤ドキュメント「ＹＭＯ“ソリッド・ステイト・サヴァイヴァー”」

録音に関わったスタッフや、YMOの音楽に衝撃を受けた人びとが魅力を語り尽くす

という内容です。2/17に再放送があるようです。

Solid State Survivorがリリースされた時ぼくは高校生でリアルタイムでYMOを経験したのです。

研究もこんな感じのprojectに参加できるとしたら研究者冥利につきますね。

とはいえ文化的雪かきもしていかないと。

やっぱり論文にもいいものもある、悪いものもありますよ。

だから論文出しましょう。

論文出ました

先月の話なのですが

先日アクセプトされた論文が出版されました https://t.co/ZnnEXB2Ew1

— 侵襲反応制御部門@KMU (@hss_kmu)

2019年1月31日

ということでアクセプトされた論文が普通の形で読めるようになっています。

Rapid bacterial identification by direct PCR amplification of 16S rRNA genes using the MinION™ nanopore sequencer FEBS Press https://t.co/NepXif7KOH

— Hirota, K. (@bodyhacker)

2019年1月31日

細菌の16S rRNA遺伝子解析を応用し、Oxford Nanopore Technologies社の新規シークエンサーMinIONを用いて迅速細菌同定システムを構築し、検体採取から細菌同定までを２時間で完了することが可能となりました、ということを示した論文です。

初期投資も20万円ほどであっけなくほど簡単にシステムが構築できました。

東海大学の先生方のご協力の賜です。

現在は時間の短縮や臨床検体を用いて検討を行っていて1.5時間までは短縮できることが解りました。

「 FACTFULNESS(ファクトフルネス)」

ファクトフルネスとは――データや事実にもとづき、世界を読み解く習慣。賢い人ほどとらわれる10の思い込みから解放されれば、癒され、世界を正しく見るスキルが身につく。 世界を正しく見る、誰もが身につけておくべき習慣でありスキル、「ファクトフルネス」を解説しよう。

という内容の本です。 冒頭に

質問 世界の1歳児で、なんらかの予防接種を受けている子供はどのくらいいる? ・A 20% ・B 50% ・C 80%

な感じのクイズが13問あってこれをネタに「世界を正しく見るスキル」を説いていくという趣向となっています。

はじめから読み進めて最後までたどりつくと「蒙を啓かれた」感に満たされることを保証します。

すこし長いので学生との読書会では課題図書にしようと思いました。

調子に乗って英語版も読みました。

読書会

医学部の学生と隔週でお昼休みに集まって読書会を開いています。

今は、仲野徹先生の「エピジェネティクス――新しい生命像をえがく」(岩波新書)を読んでいます。

次回は、「生きものとは何か 」(ちくまプリマー新書)を予定しています。

学内で参加希望の人は連絡をください。大歓迎です。

git

某総説の作業にgit導入した

— Hirota, K. (@bodyhacker)

2019年2月8日

という訳である総説で共同作業を行う必要があり今回は従来のやり方でなくgitを用いた方法でやってみようということになりました。

githubも制約はあるものの無料でプライベートリポジトリを作成できるようになりました。

使い始めると便利ですね。びっくりです。